爭議主要由下列幾類：

　　一.工程款支付爭議(此項爭議大約占了法院受理工程案件的80%)

　　二.合同效力爭議

　　三.合同解除爭議

　　四.工程質量爭議

　　五.造價結算爭議

　　六.工程款欠付利息爭議

　　七.墊資爭議

　　八.工期爭議

　　九.保修及退還保修金爭議

    一.建設資金準備不足或資金被挪用。

    1.商業性質的房地產開發：一般開發商只準備工程前期的部分資金，其余的建設資金主要通過銀行融資、房戶的預付款的收取及承包方墊資等方式來獲得。即使這樣，哪一種方式都無法保證建設資金能夠及時支付。

    2.政府公共建設工程：這類工程撥款進度常受政府辦事效率的牽制，有時專項資金會被挪用，有些會因城府部門未按合同撥付，致使最終“爛尾樓“的出現。

　　二.發包過程中不法行為遺留的后遺癥。

    1.在建設工程招標程序中出現的不法行為，對參與投標的施工單位的資質沒有把關到位，此時無相應資質的承包方通過掛靠的方式來通過資格的預審。

    2.在招投標程序中串標、泄露標底等行為的出現，致使建設工程款項被人為地抬高或壓低，待工程竣工之時發生關于公平的爭議。

   3.發包工程的肢解所產生的糾紛。發包方缺少業界責任心，將一個工程明里發包給一個承包單位，而暗里卻又將工程分割成若干的部分，指令發包給了幾個承包人，致使工程建設缺乏應有的統籌和協調，必定會在工程結算時產生爭議，從而引發工程欠款。

　　三.合同雙方權利失衡：買方市場之下，建設工程發包方濫用市場優勢。

　　多數發包方為賺取更大利益而對承包方提出一些不合理的要求，承包方在知道要求不合理的情況下為市場生存也得逆來順受，履行中卻產生了許多的爭議。

　　四.糾紛因施工企業及關聯方因自身原因導致。

    1.非法掛靠;

    2.非法轉包、違法分包;

    3.工程轉包和分包中的盤剝現象嚴重，實際施工人約定取得價款較工程成本要低；

    4.建設工程相對人法律意識淡薄，風險意識比較差，不曉得維護自身的正當利益；

    5.建設工程項目的管理不正當，表現混亂，引發了諸多的勞資糾紛；

　　五.人為糾紛：因缺乏有效地誠信機制導致的。

　　此乃建設工程領域中的大害，因其產生的糾紛多表現為發包方在竣工驗收、工程決算及工程款項的欠付，甚至是毫無根據的拖欠等方面產生的人為糾紛。

    一.法院多措施處理好工程合同糾紛案件。

    1.嚴格按照規定來審理合同糾紛;

    2.做好建設工程合同糾紛方面的調節工作;

    3.完善審判機制，加強審判監督力度;

    4.配合行政管理部門，形成合力監督機制。

　　二.全方位聯動，減少建設工程合同上的糾紛。

    1.加強政府監管職能，建立合同管理系統，健全對施工主體的審查制度;

    2.加強承包資質管理，杜絕非法轉包和違法分包;

    3.加強施工企業的工程項目管理，加大力度維護建設工程相對人的合法利益;

    4.加大工程建設規范性宣傳和培訓力度，努力構建良好的建設秩序;

    5.建立建筑施工企業淘汰制度;

    6.建立社會信用體系及信用公示制度。